Me Pasa lo mismo, llego un momento incluso que ningun agente de callcenter puede conectarse , cuando intentan logearse y eligen su usuario y anexo, el sistema no logra llamar al anexo para su autenticacion, revise la Base de datos y sus procesos, con show processlist y vi que los threads_connected eran mas de 50 y los threads_created eran como 39mil, lo que hice fue agregar en el archivo /etc/my.cnf
thread_cache_size=100
Con ello logre reducir la incidencia a 1 o 2 por dia y ya no se cae el sistema.
ME queda claro que es algo relacionado al MYSQL.
Ahora los procesos van en ciertas forma parejos:
Threads_cache=3
Threads_connected=17
Threads_create= 20
y ya no crecen desmedidamente.
Saludos