eromero esto sucede porque al archivo acl.db le faltan tablas.
dariohimo como indica aquí es copiar de otra PBX limpia copiar el archivo acl.db y reemplazarla en tu PBX dañada, hacer el cambio de clave y reintentar hacer la instalación del issabel-framework.
dejo la imagen de comparación de tablas del acl.db:
https://imgur.com/EdLBVJz
PD : dejo un archivo con las tablas faltantes, solo debes copiar el contenido y pegar en tu terminal.
https://www.dropbox.com/s/0jshtfzhzz4w81y/update%20tablas%20faltantes%20acl-db.txt?dl=0
Espero sea de ayuda para los que tengan este problema de update.