Si el problema es de base de datos podrías utilizar estas funciones desde la linea de comandos de linux.
Para verificar las tablas.
#mysqlcheck -c -u root -p --all-databases
Para repararlas
#mysqlcheck -r thegeekstuff employee -u root -p
te dejo este link para que leas un poco mas de este comando.
http://www.thegeekstuff.com/2011/12/mysqlcheck/
Saludos